1、化粪池出水，经过格栅去除大型污染物后进入预消毒池与含氯消毒剂混合反应；
2、在脱氯池，通过投加还原剂去除余氯，确保后部分生化系统的正常运行；
3、经过调节池对水质水量均衡调整，进入一体化生化处理装置，通过厌氧、好氧、沉淀等功能段进行污染物的分解去除；
4、经过消毒池消毒杀菌，确保大部分细菌以及病毒的杀灭，达到相应的排放标准。其中剩余污泥、栅渣等固体废物，通过相应分离系统汇集到污泥池后，先采用石灰和漂白粉作为消毒剂进行处理，脱水后外运交由具有危险废物处理处置资质的单位进行处理。
方舱医院污水处理应严格执行《传染病医院的标准》，医院的废水从排出到处理合格要经过多道严格的工序，经系统检测合格后，才会排入市政管网。
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